通过“试管婴儿”技术助孕妊娠的胎儿、新生儿发生遗传病、出生缺陷的机率与自然妊娠相似。到目前为止，全世界出生的试管婴儿已经超过200万名，尚无证据显示试管婴儿与自然妊娠的宝宝在体格发育、智力水平上的显著性差异，世界上首例试管婴儿出生于1978年，现已结婚，并且成功自然怀孕，使我们对试管婴儿的生育能力充满信心。由于“试管婴儿”导致多胎发生率明显增高，多胎妊娠的风险也增加，包括胎儿生长受限、宫内感染等新生儿并发症增加，这些间接增加了“试管婴儿”的出生缺陷率，但“试管婴儿”技术本身并没有增加出生缺陷发生率。
自然界的出生缺陷一直存在，故通过辅助生殖技术孕育的胎儿也面临类似概率的风险，所以确认妊娠后请到正规医院进行定期、全面的孕期检查，必要时行产前诊断。
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